Το πρωτάθλημα της Γ’ Εθνικής της περιόδου 2025-2026 θα γίνει σε έξι ομίλους των δώδεκα ομάδων.
Από τις 72 ομάδες, τέσσερις συνολικά μετά τα πλέι οφ θα ανεβούν στη Super League 2 και αντίστοιχα από τη Super League 2 θα υποβιβαστούν συνολικά οχτώ ομάδες.
Από την Γ’ Εθνική θα υποβιβαστούν μετά τα πλέι άουτ τρεις ομάδες από κάθε όμιλο (συνολικά 18 ομάδες) και θα ανεβούν από τα τοπικά 56 ομάδες (53 πρωταθλητές ΕΠΣ και οι τρεις δευτεραθλητές των ιδρυτριών Ενώσεων της ΕΠΟ) θα φτάσουμε δηλαδή στις 114 ομάδες.
Να αναφέρουμε ότι ειδικά για την Περιφέρεια Κρήτης θα σχηματιστεί την περίοδο 2026-2027 Όμιλος που θα αποτελείται από πέντε (5)Ομάδες της Ε.Π.Σ. Ηρακλείου, τρείς (3) Ομάδες της Ε.Π.Σ. Χανίων, δυο (2) Ομάδες της Ε.Π.Σ.Λασιθίου και δυο (2) Ομάδες της Ε.Π.Σ. Ρεθύμνου. Επίσης πιθανότατα θα έχουν δικαίωμα συμμετοχής στο πρωτάθλημα 2026-2027 και Β ομάδες της Super League 1. Εφόσον το επιθυμούν θα μπορούν να παίξουν στην Γ’ Εθνική.