Ο Φοίνικας Πολίχνης ιδρύθηκε στις 29 Ιανουαρίου 1955 από φιλόδοξους κατοίκους της Πολίχνης με την επωνυμία Ελληνικός Φοίνικας Πολίχνης.
Το έμβλημα του είναι ο Φοίνικας, το μυθολογικό πτηνό που αναγεννιέται από τις στάχτες του.
Τις περιόδους 1956-1957, 1957-1958 είχε αγωνιστεί στην δόκιμη κατηγορία με την ονομασία Ελληνικός Φοίνιξ, το 1958-1959 στη Γ κατηγορία με το όνομα Ελληνικός Φοίνιξ όπως και το 1959-1960 στην Β1 και το 1960-1961 στη Β’ κατηγορία της ΕΠΣΜ.
Στις 29/3/1961 μετονομάστηκε σε ΑΠΟ Φοίνικας Πολίχνης και με το όνομα Φοίνικας Πολίχνης την περίοδο 1961-1962 ανεβαίνει ως δεύτερος στην Α’ κατηγορία.
Σε πολύ μικρό χρονικό διάστημα η ομάδα της Πολίχνης πρωταγωνίστησε και εντυπωσίασε με την συνεχόμενη ανοδική πορεία της και την περίοδο 1964-1965 έπαιξε για πρώτη φορά στη Β’ Εθνική όπου τερμάτισε τρίτος.
Από το 1969 ως το 1975 ο Φοίνικας γράφει την ιστορία του με χρυσά γράμματα και η ομάδα γίνεται γνωστή πανελληνίως, με τις επιτυχίες της κόντρα σε πολύ μεγάλες ομάδες. Μετά από τρία παιχνίδια με τον Πυρσό Γρεβενών όπου έχασε με 1-0, νίκησε 2-1, και σε ουδέτερο γήπεδο στη Βέροια νίκησε στις 12 Ιουλίου 1970 με 2-1 στην παράταση, ανέβηκε στη Β’ Εθνική όπου αγωνίστηκε για πέντε αγωνιστικές περιόδους. Tα γκολ του Φοίνικα στο τελευταίο παιχνίδι με τον Πυρσό πέτυχαν οι Παύλος Κωνσταντινίδης και Αβραμίδης στην παράταση.
Πολλές διακρίσεις είχε ο Φοίνικας και στο Κύπελλο της ΕΠΣΜ. Το 1980 έχασε στον τελικό Κυπέλλου της ΕΠΣΜ από τον Μαραθώνα με 1-0 στην παράταση.
Τον επόμενο χρόνο και συγκεκριμένα το 1981 κατακτά το κύπελλο καθώς νίκησε με 3-1 την ομάδα του Κεραυνού Αγγελοχωρίου. Το 2002 νίκησε στον τελικό με 2-1 την ομάδα των Λύκων και το 2006 με 1-0 στην παράταση τον Ιωνικό.
Τον Σεπτέμβριο του 2002 ο Φοίνικας είχε χάσει για το σούπερ Καπ από τον Μακεδονικό με 3-0 και το 2006 από τον ΠΑΟΔ με 1-0.
Eπαιξε στη Β’ Εθνική την περίοδο 1964-1965 και από το 1970 µέχρι το 1975.
Στην τρίτη κατά σειρά εθνική κατηγορία: 1965-1966 και 1966-1967.
Στην Εθνική ερασιτεχνική (Τρίτη κατηγορία) από το 1978 µέχρι το 1982
Εθνική ερασιτεχνική (τέταρτη κατηγορία):
Την περίοδο 1987-1988 σε αγώνα του Οδυσσέα Κορδελιού με τον Φοίνικα Πολίχνης που έγινε στο γήπεδο του Μακεδονικού σημειώθηκε ρεκόρ εισιτηρίων καθώς κόπηκαν 4380. Οι δύο ομάδες που ήταν πρώτες των ομίλων τους στο πρωτάθλημα της Α' κατηγορίας της ΕΠΣΜ ανέβηκαν τελικά στη Δ' Εθνική, κάτι που δεν συνέβη με την Προοδευτική καθώς τερμάτισε τρίτη στο πρωτάθλημα ενός γύρου που αγωνίστηκαν μεταξύ τους οι τρεις ομάδες.
Δ Εθνική: Επαιξε ο Φοίνικας Πολίχνης από το 1988 µέχρι το 1993 και ακόμη την περίοδο 1994-1995.
O Φοίνικας Πολίχνης έχει 16 συμμετοχές στην ιστορία της Α1
Επαιξε σε δύο Σούπερ Καπ και είχε τα εξής αποτελέσματα 2002: Μακεδονικός-Φοίνικας Πολίχνης 3-0, 2006 ΠΑΟ∆-Φοίνικας Πολίχνης 1-0
Το 1965-1966 ο Φοίνικας Πολίχνης έπαιξε στη φάση των 32 του κυπέλλου Ελλάδας και νίκησε εκτός έδρας την Νίκη Βόλου με 1-2. Στην φάση των 16 έχασε από τον Εθνικό με 4-1.
Το 1974-1975 έχασε στη φάση των 32 από το Αιγάλεω με 4-1.
Μετροσπορτ
70 χρόνια συμπληρώνονται φέτος από την γενέθλια ημέρα του Φοίνικα Πολίχνης.
Στις 29 Ιανουαρίου 1955 μια παρέα φιλάθλων από την προσφυγική περιοχή της βορειοδυτικής Θεσσαλονίκης αποφάσισε να συστήσει μια ομάδα που έμελλε να γράψει τη δική της ιστορία στα ερασιτεχνικά αλλά και στα εθνικά πρωταθλήματα
Στο πλαίσιο αυτό ο δήμος Παύλου Μελά και ο Φοίνικας Πολίχνης σε συνεργασία με τον δημοσιογράφο ερευνητή ποδοσφαίρου Παναγιώτη Χαραλαμπίδη ετοιμάζουν μια μεγάλη επετειακή εκδήλωση για τα 70 χρόνια προσφοράς και δράσης της ομάδας.
Ιδιαίτερη αναφορά θα γίνει στις ομάδες που πρωταγωνίστησαν στα δύσκολα χρόνια της Β εθνικής 1964-1965 και 1970-1975.
Θα τιμηθούν μεγάλες δόξες εκείνης της εποχής οι εν ζωή ποδοσφαιριστές των δύο εκείνων περιόδων. Θα ακολουθήσει ιστορική αναδρομή στις επόμενες περιόδους που πρωταγωνίστησε η ομάδα στα Πρωταθλήματα της Γ, Δ’ Εθνικής ερασιτεχνικής και φυσικά στην πλούσια ιστορία της στα τοπικά πρωταθλήματα της ΕΠΣΜ με αποκορύφωμα τις κατακτήσεις τριών κυπέλλων.